1、HLA基因检查
HLA抗原即人白血球抗原，这是一种人类白细胞表面的蛋白，位于细胞的表面，看起来像天线，起着通讯兵的作用，它负责识别人体外来物，如果发现来外物是有害的（如细菌、病毒等）它就通知白细胞做好免疫抵抗准备，一旦有害侵入物接近，已经准备好免疫抵抗的白细胞立马将其杀死；如果它发现外来物不是有害的（称之为同种异型免疫，如胚胎），它就会产生封闭抗体，给来外物披上“自己人”的外衣，让它生长发育。
如果男方的HLA基因型和女方太过于一致，长得几乎一模一样，这个时候女方就无法识别它是有害还是有益的统统归为有害（宁可错杀一千不可放过一个），如果是胚胎，女方身体就不产生封闭抗体来保护它。既然认为他是有害的，全身的免疫系统得到HLA的指示已经做好了防御和攻击准备，胚胎想着床和发育真的是难上加难；就算侥幸躲过攻击胚胎着床了，源源不断的具有杀伤力的免疫细胞的攻击，胚胎就别想发育了，于是生化、胎停和流产便不可避免。
2、封闭抗体
封闭抗体的缺乏也是反复自然流产的重要原因之一。胎儿胎盘不被母体排斥，依赖母体产生封闭抗体及其他免疫抑制物质，从而阻止有害的母体反应。封闭抗体主要是针对胚胎HLA-Ⅱ类抗原和淋巴细胞交叉反应抗原而产生的，可通过与胎儿胎盘滋养叶抗原结合或母体淋巴细胞结合而防止胚胎父系抗原被母体免疫系统识别和杀伤，阻止胚胎滋养层遭受免疫攻击，有助于维持妊娠。
3、血型和血型抗体
这是由于夫妻双方的血型不合导致的流产，尤其O型血母亲容易因为血型不合而发生复发性自然流产（因O型母体对AB抗原均可产生IgG抗体，并可通过胎盘屏障）。异常增高的血型抗体作用于滋养层细胞或通过胎盘进入胎儿体内，导致胎儿- 胎盘单位多器官组织细胞的损伤，从而发生流产。
4、夫妻双方亚甲基四氢叶酸还原酶
亚甲基四氢叶酸还原酶（MTHFR）是叶酸代谢中的关键酶，在MTHFR基因多态性可导致该酶活性的降低。这种酶在体内有至关重要的作用，并参与DNA的合成。MTHFR基因多态性与男性不育及育龄女性复发性流产有关，将可能导致体内高同型半胱氨酸水平和DNA合成障碍及低甲基化反应 ，使人体叶酸代谢发生障碍。
5、抗磷脂抗体
抗磷脂抗体阻止细胞结构的转化，引发能破坏血管壁的免疫反应，导致血细胞在胎盘组织及其微小的血细胞壁上形成血块或血栓，这样就阻断了胎盘与母体的融合，阻止了滋养层的发育，胎儿会像花儿一样枯萎凋谢。这种抗体阳性的孕妇会承担流产的危险，极可能在早早孕期失去胎儿；并且孕妇自身也承担着血栓的危险，并且随着怀孕失败次数的增加，血栓形成倾向也会增加。
6、抗甲状腺抗体
抗甲状腺抗体阳性的女性血液中有着高水平的CD56+NK细胞，CD19+/5+细胞和过度活跃的T细胞。专家认为NK细胞破坏甲状腺快速分裂的甲状腺细胞并最终导致流产、着床失败和不孕。这就是本身有抗甲状腺抗体女性不适合怀孕的原因。
7、抗核抗体
抗核抗体阳性率为51. 5%，提示人体有自身免疫过程发生，该过程影响胎盘发育，易引起免疫复合物在蜕膜血管沉着，是蜕膜血管受损而导致流产。抗透明带抗体可引起母- 胎免疫识别过度，增加母体对胎儿-胎盘的免疫损伤作用，加速了对胚胎的免疫排斥反应。
8、各类生殖抗体
抗生殖免疫抗体包括抗精子抗体、抗子宫内膜抗体、抗卵巢抗体、抗绒毛膜促性腺激素抗体、抗苗勒氏管激素、抗滋养层抗体和抗透明带抗体。
抗精子抗体干扰精子的代谢和获能，还影响受精、受精卵着床和胚胎发育，最后导致流产。正常情况下，女方会形成免疫耐受，即不发生对精子的免疫反应和产生抗体。当外伤、感染、理化等因素造成女性生殖道的生理屏障破坏时，大量精子会通过淋巴进入血液循环，导致免疫反应并产生抗精子抗体。正常育龄妇女血清及宫颈粘液不含抗精子抗体，反复自然流产妇女血清阳性率为36. 4%。
抗子宫内膜抗体在正常育龄妇女中是没有的。但由于子宫内膜损伤、炎症等原因使内膜组织作为自身抗原刺激机体产生的抗子宫内膜抗体，激活补体反应，破坏子宫内膜的结构，使子宫内膜发育不良及对孕卵的接受性降低，不利于孕卵着床，导致不孕和流产。
抗卵巢抗体是一种将卵巢中的各种细胞当成靶抗原形成的一种抗体。在感染、创伤、反复穿刺取卵或促排卵药物的作用下，造成大量卵巢抗原释放，刺激机体产生抗卵巢抗体，引起自身免疫性卵巢炎、颗粒细胞、黄体细胞的损伤造成雌、孕激素合成分泌不足，子宫内膜分泌期改变不充分，影响卵泡发育、成熟、加快卵巢闭锁、生长卵泡减少、卵子过早退化，不能支持胚胎发育引起流产。
抗绒毛膜促性腺激素抗体的主要作用是促进卵巢黄体进一步发育形成妊娠黄体及分泌足够的雌孕激素，对维持早期妊娠、阻止母体对胎儿的排斥反应起着关键作用。绒毛组织中的绒毛膜促性腺激素可作为抗原刺激母体产生抗绒毛膜促性腺激素抗体，抗绒毛膜促性腺激素抗体可以阻断绒毛膜促性腺激素的作用，导致妊娠不能维持，使得受精卵不能着床，引起临床上习惯性流产或胚胎停止发育。
抗苗勒氏管激素在育龄女性的任何时期均可预测卵巢反应性，在未进入周期的卵泡中也能证实其活性，且不受FSH 的干扰，能如实反映出原始卵泡的储备情况，所以对评估卵巢储备功能有很好的预测价值，特别是对年龄≥35 岁的不孕妇女。
抗滋养层细胞膜抗体在不明原因流产的妇女血清中，比正常孕妇明显增高，这种抗体的增加与流产之间有着密切联系。当夫妇间具有相同的滋养层细胞膜抗原时，不能激发母体产生封闭抗体，从而遭受母体免疫攻击而流产。因此，抗滋养层抗体存在从某种程度上提示封闭抗体不足。抗滋养层细胞抗体的检测，主要作为反复流产患者的辅助诊断指标。如果是曾经有流产史的女性结果属于阳性，应该在转阴之后考虑怀孕。
抗透明带抗体与透明带的结合，可干扰卵泡和卵细胞间的信息交流，掩盖透明带上的精子，使卵子失去与同种精子结合的能力。加之抗透明带抗体对含透明带的孕卵产生损伤作用，孕卵即使着床也因前期的损伤而不能正常发育，这种情形仅可能发生在孕早期。因此， 抗透明带抗体引起的反复自然流产常为原发性流产。
9、其他检测
Th1 /Th2比率、干扰素γ和肿瘤坏死因子
Th1 /Th2型细胞因子的失衡与反复自然流产有关。CD4 +辅助性T细胞根据其分泌的细胞因子不同可分为具有两种功能不同的亚群，即Th1 (T辅助细胞1)和Th2 ( T辅助细胞2)细胞。Th1细胞以分泌白细胞介素2、干扰素γ和肿瘤坏死因子为主; Th2细胞以产生白细胞介素4、5、6 和10为主。
Th1型细胞因子主要介导细胞免疫和局部炎症反应，参与免疫应答，与免疫损伤有关。Th2型细胞因子主要促进B细胞增殖和抗体生成、介导体液免疫，参与介导免疫耐受形成。妊娠是以Th2型细胞因子为主的生理现象，反复自然流产妇女蜕膜免疫细胞产生过量胚胎毒性细胞因子，Th1/Th2 平衡偏向Th1，而 Th2受抑制。
主要由Th1细胞分泌的干扰素γ(IFN – γ)可抑制滋养层的生长，如与肿瘤坏死因子(TNF – α)协同作用可抑制胚胎的发育。INF – γ还能诱导吞噬细胞到胎盘部位，损伤胎盘滋养层细胞，影响胎盘功能而导致流产。
肿瘤坏死因子(TNF – α)参与滋养层细胞的凋亡，并可损伤胎盘中的血管，使血管平滑肌收缩，造成胎儿的供血系统发生栓塞，造成胚胎、胎儿的死亡、流产。TNF -α与IL – 2共同作用可使NK样细胞转化成具有细胞毒性的淋巴因子激活的杀伤细胞，对胎盘组织产生损害。
在妊娠过程中，并非是Th1型细胞因子的含量越低越好，也不是Th2型细胞因子的含量越高越好，关键在于Th1 /Th2型细胞因子之间比例和动态平衡。其平衡如被打破，比例过高或过低可能都与病理妊娠的发生有关。至于在妊娠的各个时期，这个合适的比例及各个细胞因子的正常值范围，缺乏足够的临床资料，到目前为至还没有一个确切的标准。
